Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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