Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms