Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 AC013553.3-201ENST00000612943 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ILK-216ENST00000627400 111 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 SNORA50B-202ENST00000630737 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 AC089987.1-202ENST00000641959 426 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 TACC1P1-201ENST00000425494 1454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 CLUHP4-201ENST00000507604 1343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT7-201ENST00000268533 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 NSMCE2-201ENST00000287437 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 C22orf15-202ENST00000382821 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 OR10D5P-201ENST00000392760 915 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 MANBAL-203ENST00000397150 620 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 KANK1P1-201ENST00000400619 1234 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 PPIL3-204ENST00000409361 897 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-1Q3LI63 AC245060.2-201ENST00000412149 524 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms