Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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