Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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