Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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