Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms