Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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