Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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