Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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