Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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