Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms