Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms