Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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