Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms