Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms