Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms