Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms