Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms