Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ITGB6P18564 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGB6P18564 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGB6P18564 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGB6P18564 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGB6P18564 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGB6P18564 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGB6P18564 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGB6P18564 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGB6P18564 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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