Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms