Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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