Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPDC1A2A3K4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms