Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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