Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms