Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms