Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms