Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms