Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms