Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms