Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms