Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms