Protein–RNA interactions for Protein: Q86V20

FAM35A, Protein FAM35A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM35AQ86V20 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM35AQ86V20 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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FAM35AQ86V20 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM35AQ86V20 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM35AQ86V20 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM35AQ86V20 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FAM35AQ86V20 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM35AQ86V20 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM35AQ86V20 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM35AQ86V20 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM35AQ86V20 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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