Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms