Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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