Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms