Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms