Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms