Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms