Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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