Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HIST3H3Q16695 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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