Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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