Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms