Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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