Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms