Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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