Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TLR1Q15399 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TLR1Q15399 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TLR1Q15399 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TLR1Q15399 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TLR1Q15399 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TLR1Q15399 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TLR1Q15399 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TLR1Q15399 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TLR1Q15399 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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