Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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