Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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