Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SHPRHQ149N8 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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